微波消解法作為一種樣品的前處理方法，以其快速、溶劑用量少、節省能源、易于實現自動化等優點而廣為應用。但在使用過程中應注意以下幾個方面。
微波消解儀安裝注意事項：
微波消解儀不應安放于通風柜內
微波消解儀的四周及頂部不得有遮蓋，且至少要有0.2米的空隙
安裝微波消解儀的實驗臺，應該水平、穩固，并且靠近通風櫥等通風裝置
微波消解儀應遠離水源和強磁干擾的環境
消解罐使用注意事項：
確認消解內罐材質
確認消解罐高使用溫度和大使用壓力
稱樣量（可消解樣品量）
消解罐內罐、外罐的組裝配合與松緊度
消解罐的清洗
不同樣品消解需要注意的事項：
不要用硝酸消解的物質：苯酚、三乙胺和動物脂肪。
對含有脂肪、油脂、乙醇、芳香族化合物、硝基芳香族化合物等樣品，必須經過適當的預處理后方可進行密閉式微波消解，否則會引起爆罐。
密閉式微波消解中嚴禁使用高氯酸，高氯酸與有機物在一起有爆炸的危險，
大多數軟膠囊殼中甘油的含量較高，按藥典中“明膠空心膠囊”鉻檢查方法處理軟膠囊殼容易發生爆罐的危險，需適當改進方法和操作后方可進行試驗。
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